जाकिर नाइक के एनजीओ इस्लामिक रिसर्च फाउंडेशन पर प्रतिबंध लगने से देशभर में चल रहे इसके ऑफिस बंद हो जाएंगे। आईबी ने जाकिर नाइक के भाषणों की गहराई से जांच की है। आईबी की रिपोर्ट के बाद सरकार ने जाकिर के एनजीओ पर बैन लगाने का फैसला लिया।
जाकिर नाइक का नाम उस समय चर्चा में आया जब जांच में यह पता चला कि ढाका कैफे में हुए आतंकी हमले में शामिल आतंकी उसके भाषणों से प्रभावित थे। बांग्लादेश सरकार की ओर से जांच में यह जानकारी मिलने पर भारत सरकार ने जाकिर के खिलाफ जांच शुरू की। उस वक्त जाकिर सऊदी अरब की यात्रा पर था लेकिन कार्रवाई के डर से वह भारत वापस नहीं आया।